Codificación genética de nuevos aminoácidos en células madre embrionarias para la comprensión molecular de la diferenciación de las neuronas de dopamina
Detalles de la concesión de la subvención
Tipo de subvención:
Conceder número:
RN1-00577
Investigador(es):
Enfoque de la enfermedad:
Valor del premio:
$2,587,742
Estatus
Cerrado
Informe de progreso
Período de información:
Los estudiantes de Year 2
Período de información:
Los estudiantes de Year 3
Período de información:
Los estudiantes de Year 4
Período de información:
Año 5 +NCE
Detalles de la solicitud de subvención
Titulo de la aplicación:
Codificación genética de nuevos aminoácidos en células madre embrionarias para la comprensión molecular de la diferenciación de las neuronas de dopamina
Resumen público:
Las células madre embrionarias tienen la capacidad de autorrenovarse y diferenciarse en otros tipos de células. Comprender cómo se regula esto a nivel molecular nos permitiría manipular el proceso y guiar a las células madre para generar tipos específicos de células para un trasplante seguro. Sin embargo, redes complejas de cofactores intracelulares y señales externas del medio ambiente afectan el destino de las células madre. Diseccionar estas interacciones moleculares en células madre es una tarea muy desafiante y requiere nuevas estrategias innovadoras. Proponemos incorporar genéticamente nuevos aminoácidos en proteínas directamente en células madre. A través de estos aminoácidos podremos introducir nuevas propiedades químicas o físicas de forma selectiva en proteínas diana para un estudio biológico preciso en células madre.
Nurr1 es un receptor hormonal nuclear que se ha asociado con la enfermedad de Parkinson (EP), que ocurre cuando las neuronas de dopamina (DA) comienzan a funcionar mal y mueren. La sobreexpresión de Nurr1 y otras proteínas puede inducir la diferenciación de células madre neurales y células madre embrionarias en neuronas de dopamina (DA). Sin embargo, estas neuronas DA no sobrevivieron bien en un modelo de ratón con EP después del trasplante. Además, no está claro cómo Nurr1 regula el proceso de diferenciación y qué otros cofactores están involucrados. Proponemos introducir genéticamente un nuevo aminoácido que transporta un grupo fotoentrecruzante en Nurr1 en células madre. Tras la iluminación, las moléculas que interactúan con Nurr1 se unirán permanentemente para su identificación mediante espectrometría de masas. Con este enfoque, nuestro objetivo es identificar cofactores desconocidos que regulan la función de Nurr1 o que están controlados por Nurr1, y mapear sitios en Nurr1 que pueden unirse a agonistas. La función de los cofactores identificados en la especificación y maduración de las neuronas DA se probará en células madre embrionarias de ratón y humanas. Estos cofactores se variarán en combinación para buscar formas más eficientes de inducir a las células madre embrionarias a generar una población pura de neuronas DA. Las neuronas DA generadas se evaluarán en un modelo de ratón con EP. Además, la identificación del sitio de unión del agonista en Nurr1 facilitará el diseño y la optimización futuros de fármacos potentes.
Nurr1 es un receptor hormonal nuclear que se ha asociado con la enfermedad de Parkinson (EP), que ocurre cuando las neuronas de dopamina (DA) comienzan a funcionar mal y mueren. La sobreexpresión de Nurr1 y otras proteínas puede inducir la diferenciación de células madre neurales y células madre embrionarias en neuronas de dopamina (DA). Sin embargo, estas neuronas DA no sobrevivieron bien en un modelo de ratón con EP después del trasplante. Además, no está claro cómo Nurr1 regula el proceso de diferenciación y qué otros cofactores están involucrados. Proponemos introducir genéticamente un nuevo aminoácido que transporta un grupo fotoentrecruzante en Nurr1 en células madre. Tras la iluminación, las moléculas que interactúan con Nurr1 se unirán permanentemente para su identificación mediante espectrometría de masas. Con este enfoque, nuestro objetivo es identificar cofactores desconocidos que regulan la función de Nurr1 o que están controlados por Nurr1, y mapear sitios en Nurr1 que pueden unirse a agonistas. La función de los cofactores identificados en la especificación y maduración de las neuronas DA se probará en células madre embrionarias de ratón y humanas. Estos cofactores se variarán en combinación para buscar formas más eficientes de inducir a las células madre embrionarias a generar una población pura de neuronas DA. Las neuronas DA generadas se evaluarán en un modelo de ratón con EP. Además, la identificación del sitio de unión del agonista en Nurr1 facilitará el diseño y la optimización futuros de fármacos potentes.
Declaración de beneficio para California:
La enfermedad de Parkinson (EP) es el segundo trastorno neurodegenerativo humano más común y se debe principalmente a la degeneración selectiva y progresiva de las neuronas dopaminérgicas (DA) del mesencéfalo ventral. El trasplante de células de neuronas DA diferenciadas de células madre neurales o células madre embrionarias generó grandes esperanzas de mejorar el tratamiento para los pacientes con EP. Sin embargo, las neuronas DA derivadas mediante los protocolos actuales no sobreviven bien en modelos de enfermedad de Parkinson en ratones, y los detalles del desarrollo de las neuronas DA a partir de células madre no están claros. Nuestra investigación propuesta identificará cofactores desconocidos que regulan la diferenciación de células madre embrionarias en neuronas DA y determinará cómo los agonistas activan Nurr1, un receptor hormonal nuclear esencial para la especificación y maduración de las neuronas DA. Este estudio puede generar nuevos objetivos farmacológicos e inspirar nuevas estrategias preventivas o terapéuticas para la EP. Estos descubrimientos pueden ser explotados por la industria biotecnológica de California y beneficiar económicamente a los californianos. Además, buscaremos métodos más eficientes para diferenciar células madre embrionarias humanas en neuronas DA y evaluaremos sus efectos terapéuticos en modelos de ratón con EP. Por lo tanto, la investigación propuesta también beneficiará directamente a los residentes de California que padecen EP.
Publicaciones
- Métodos Nat (2013): Agregar un enlace covalente no natural a las proteínas mediante biorreactividad mejorada por proximidad. (PubMed: 23913257)
- Química Biol (2009): Ampliación del código genético para estudios biológicos. (PubMed: 19318213)
- Células madre (2011): Codifica genéticamente aminoácidos no naturales en células madre neuronales e informa ópticamente cambios de dominio sensibles al voltaje en neuronas diferenciadas. (PubMed: 21681861)
- Angew Chem Int Ed Engl (2011): Fotoentrecruzadores incorporados en receptores acoplados a proteína G en células de mamíferos: una comparación de ligandos. (PubMed: 21751313)
- ACS Química Biol (2012): El factor de liberación uno no es esencial en Escherichia coli. (PubMed: 22662873)
- Nat Chem Biol (2011): La eliminación de RF1 permite la incorporación ribosomal de aminoácidos no naturales en múltiples sitios. (PubMed: 21926996)
- ACS Química Biol (2011): Base estereoquímica para la pirrolisil-tRNA sintetasa diseñada y la incorporación in vivo eficiente de aminoácidos no nativos estructuralmente divergentes. (PubMed: 21545173)