Desarrollo de un enfoque basado en células madre para interpretar los efectos globales de las variantes genéticas que contribuyen al riesgo de enfermedades del desarrollo neurológico

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Detalles de la concesión de la subvención

Tipo de subvención:
Fundación – Proyectos de investigación en etapa de descubrimiento
Conceder número:
DISCO0-13808
Investigador(es):
Nombre:
Dra. Alexis Komor
Institución:
Universidad de California, San Diego
Tipo:
PI

Enfoque de la enfermedad:
Desórdenes neurológicos, Síndrome de Rett
Uso de células madre humanas:
Célula IPS
Valor del premio:
$1,518,982
Estatus
Activo(s)

Informe de progreso

Período de información:
Los estudiantes de Year 3

Detalles de la solicitud de subvención

Titulo de la aplicación:

Desarrollo de un enfoque basado en células madre para interpretar los efectos globales de las variantes genéticas que contribuyen al riesgo de enfermedades del desarrollo neurológico

Resumen público:
Objetivo de la investigación

Estamos desarrollando una estrategia para caracterizar la relevancia de la enfermedad de cientos de mutaciones en diversos orígenes genéticos utilizando células madre.

Impacto

Comprender cómo las mutaciones afectan la función celular puede identificar tratamientos para enfermedades genéticas, pero actualmente menos del 1% de las mutaciones identificadas tienen una función conocida.

Principales actividades propuestas

  • Identificar las condiciones óptimas para la introducción de la biblioteca SNV en hiPCS y caracterizar el impacto global de las mutaciones individuales en ERCC2 y MECP2 en la transcripción, el estado de la cromatina y las tasas de mutación.
  • Desarrollar un proceso computacional para diseñar bibliotecas SNV y analizar datos de nuestro método, scBE-seq
  • Emplear scBE-seq para estudiar el impacto de bibliotecas de mutaciones en ERCC2 y MECP2 durante la neurodiferenciación in vitro de hiPSC en organoides corticales
  • Analice los datos de scBE-seq y compárelos con conjuntos de datos ortogonales para la interpretación clínica de la variación genética
Declaración de beneficio para California:
Una representación excesiva de los datos europeos sobre la secuenciación del genoma humano ha generado desigualdades en los esfuerzos de la medicina regenerativa y de precisión. Proponemos aquí desarrollar una estrategia más equitativa para caracterizar la relevancia de las mutaciones en la enfermedad de diversas poblaciones. Nuestro proyecto identificará nuevas estrategias preventivas, tratamientos y curas para enfermedades genéticas aplicables a una variedad de grupos étnicos y, por lo tanto, beneficiará al estado de California y a sus ciudadanos étnicamente diversos.

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