Una herramienta de contexto de cromatina para predecir la predisposición del linaje de iPS y la capacidad de injerto de tejidos

Las terapias basadas en trasplantes de células se anuncian como nuevas opciones de tratamiento con aspiraciones a menudo curativas para muchos tipos diferentes de enfermedades. En particular, las células madre pluripotentes inducidas (iPS) son células de donantes potenciales intrigantes porque pueden derivarse de pacientes individuales evitando el rechazo de trasplantes y, en teoría, pueden diferenciarse en un número ilimitado de células de donantes especializadas. Un obstáculo importante que limita su utilidad es la observación de que las líneas celulares iPS son heterogéneas y que las líneas celulares iPS del mismo paciente se comportan de manera diferente cuando los científicos intentan diferenciarlas en un tejido en particular. Nuestra herramienta de contexto de cromatina proporcionará una solución a este problema, ya que busca predecir qué línea celular iPS será utilizable para una diferenciación eficiente. La herramienta se basa en la observación de que los factores críticos de determinación del linaje que regulan los genes necesitan acceder a las secuencias diana adecuadas y que estos sitios genéticos requieren una configuración epigenética permisiva para poder acceder correctamente. El desarrollo exitoso de la herramienta eliminará muchas semanas de costosas pruebas y errores y ayudará a identificar prospectivamente aquellas líneas que pueden usarse para terapia. Por lo tanto, nuestra herramienta cerrará una brecha crítica que obstaculiza la aplicación clínica de estas nuevas e interesantes terapias basadas en células y, por lo tanto, beneficiará a todos los californianos que padecen una enfermedad que podría tratarse con un trasplante de células iPS.