Centro de excelencia para la genómica de células madre - Stanford

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades en California Stem Cell Genomics. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). ). En el primer año del premio, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales para compartir el progreso de la investigación y coordinar actividades en todo el Centro. El 1 de mayo de 2015, el CESCG celebró su primer retiro en todo el centro en un evento de un día en el Clark Center en el campus de la Facultad de Medicina de Stanford. Los dos PIC han logrado avances significativos. CIP1 ha generado un recurso valioso de 38 líneas de células madre pluripotentes inducidas y ha establecido una plataforma confiable para la derivación de alto rendimiento de cardiomiocitos derivados de células madre pluripotentes inducidas por humanos para su uso en ensayos de detección de farmacología de fármacos y toxicidad de alto rendimiento posteriores. CIP2 ha completado el primer análisis del cerebro unicelular humano y está en el proceso de derivar un mapa pancreático unicelular. Hemos lanzado nuestra subvención colaborativa para el progreso de la investigación. Tras la recepción de solicitudes en octubre de 2014 y una revisión exitosa en enero de 2015, el Núcleo Administrativo de Stanford también otorgó adjudicaciones de subcontrato para 3 CRP administrados por el CESCG desde el sitio del norte de California: dos adjudicaciones de proyecto integral CRP-C2 a Daniel Geschwind de UCLA y CRP-C3 a Arnold Kriegstein de UCSF, y un premio de proyecto regular CRP-R4 a Jeremy Sanford de UCSC. Estas actividades transformarán la investigación con células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades relacionadas con la genómica de células madre en el estado de California. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). . En el segundo año del premio, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales para compartir el progreso de la investigación y coordinar actividades en todo el centro. El 29 de abril de 2016, el CESCG celebró su segundo retiro en todo el centro en un evento de un día en el Instituto Salk. Los dos PIC han logrado avances significativos. CIP1 ha reclutado a 102 donantes y ha generado un recurso valioso de 71 líneas de células madre pluripotentes inducidas. Se ha completado la secuenciación completa del genoma del primer lote de 10 iPSC y el análisis de los datos está en marcha. CIP1 también comenzó a diferenciar un conjunto inicial de iPSC en cardiomiocitos y los trató con varios fármacos. Se está realizando RNA-seq para detectar los efectos del tratamiento farmacológico. CIP2 ha completado el primer análisis del cerebro unicelular humano y está terminando la derivación de un mapa pancreático unicelular fetal y adulto. También hemos lanzado nuestra segunda convocatoria de subvenciones CRP. Luego de la recepción de las solicitudes de la convocatoria 2 el 30 de octubre de 2015 y la revisión exitosa el 15 de enero de 2016, el Núcleo Administrativo de Stanford emitió adjudicaciones de subcontrato a cuatro CRP que serán administrados por el sitio CESCG del norte de California. Los investigadores principales de estos CRP son Jacob Corn de Berkeley, Jeanne Loring de Scripps, Irving Weissman de Stanford y Gene Yeo de UCSD. Estos proyectos de investigación de los CIP y CRP transformarán la investigación con células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades relacionadas con la genómica de células madre en el estado de California. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). . En el tercer año del premio, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales para compartir el progreso de la investigación y coordinar actividades en todo el centro. Los días 20 y 21 de abril de 2017, el CESCG celebró su tercer retiro anual CIRM genómico de células madre en la Universidad de Stanford. CIP1 ha recolectado 180 muestras de sangre en total y generó un recurso valioso de 164 líneas de células madre pluripotentes inducidas. Se completó la secuenciación completa del genoma del primer lote de 34 iPSC y se analizaron los datos. CIP1 también diferenció 26 iPSC en cardiomiocitos y las trató con varios fármacos seguidos de RNA-Seq. CIP2 ha logrado establecer un flujo de trabajo para Patch-seq en un esfuerzo por acoplar la función celular y la genómica y métodos in situ para localizar los candidatos identificados previamente a partir de RNAseq de tejidos primarios. Además, publicaron un manuscrito en Bioarxiv que presenta resultados del análisis de tejido pancreático fetal y adulto, y se está revisando otro manuscrito que describe las células infiltrantes en el glioblastoma. Todos los demás colaboradores de CRP han logrado avances significativos en sus proyectos. Estos proyectos de investigación de los CIP y CRP transformarán la investigación con células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades relacionadas con la genómica de células madre en el estado de California. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). . En el cuarto año del premio, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales para compartir el progreso de la investigación y coordinar actividades en todo el centro. Los días 17 y 18 de mayo de 2018, el CESCG celebró su cuarto retiro anual CIRM genómico de células madre en el Instituto Salk. CIP1 ha recolectado 289 muestras de sangre en total y generó un recurso valioso de 249 líneas de células madre pluripotentes inducidas. Se completó la secuenciación completa del genoma del primer lote de 207 iPSC y se analizaron los datos. CIP1 también ha diferenciado 49 iPSC en cardiomiocitos y los ha tratado con varios fármacos seguidos de RNA-Seq. CIP2 ha finalizado la recolección de células de páncreas estudiadas por células patch-clamp y seguidas por RNA-seq unicelular. Han recolectado más de 1,000 células que pasaron el control de calidad después de la secuenciación, incluidas más de 300 células de donantes con diabetes tipo 2. Se han realizado mejoras adicionales al método TCL-Seq. Se han reducido los costos del proceso de secuenciación de ARNm unicelular y se ha aumentado drásticamente el rendimiento. Además, se está redactando un manuscrito sobre el páncreas fetal. Todos los demás colaboradores de CRP han logrado avances significativos en sus proyectos. Estos proyectos de investigación de los CIP y CRP transformarán la investigación con células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades relacionadas con la genómica de células madre en el estado de California. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). . En el quinto año del premio, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales para compartir el progreso de la investigación y coordinar actividades en todo el centro. Los días 18 y 19 de mayo de 2019, el CESCG celebró su quinto retiro anual CIRM genómico de células madre en la Universidad de Stanford. CIP1 ha completado el reclutamiento, reprogramación y WGS de las líneas enfermas de nuestro biobanco. CIP1 también ha diferenciado una gran cantidad de iPSC en cardiomiocitos y los ha tratado con varios fármacos seguidos de RNA-Seq. CIP2 se ha centrado en el análisis de datos, haciéndolos públicos a través del navegador celular, redacción de manuscritos e impulsando la ligadura cromática dirigida a la automatización y la sensibilidad unicelular. Todos los demás colaboradores de CRP han logrado avances significativos en sus proyectos. Estos proyectos de investigación de los CIP y CRP han dado lugar a más de 36 publicaciones y varias herramientas bioinformáticas que transformarán la investigación de células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.

Esta subvención ha permitido una gran cantidad de actividades relacionadas con la genómica de células madre en el estado de California. Se ha establecido el Núcleo Administrativo de Stanford para el Centro de Excelencia en Genómica de Células Madre (CESCG) y es responsable de supervisar las actividades conjuntas del centro y la administración de los proyectos iniciados por el centro (CIP) 1 y 2, y varios proyectos de investigación colaborativa (CRP). . En el período de extensión sin costo (NCE) de la adjudicación, la administración del CESCG organizó conferencias telefónicas mensuales del CIP1 y coordinó actividades de los proyectos del CRP que solicitaron NCE. CIP1 completó la reprogramación del biobanco de 300 líneas iPSC, generó el WGS de estas líneas e identificó mutaciones candidatas para el 30% de las líneas enfermas. CIP1 también diferenció aproximadamente la mitad del biobanco en cardiomiocitos y los trató con varios medicamentos seguidos de RNA-seq, e identificó genes correlacionados tanto con la enfermedad como con la contractilidad. CIP2 cumplió sus objetivos al final del último período de informe y no requirió una NCE. Todos los demás colaboradores del CRP que solicitaron un NCE han completado sus proyectos de secuenciación. Estos proyectos de investigación de los CIP y CRP han dado lugar a más de 40 publicaciones y varias herramientas bioinformáticas que transformarán la investigación de células madre en California y continuarán su preeminencia en esta área.