Análisis de la carga mutacional de todo el genoma de tres métodos de inducción de pluripotencia.

Año de publicación:

2016

Autores:

Kunal Bhutani, Kristopher L Nazor, Roy Williams, Ha Tran, Heng Dai, Zeljko Dzakula, Edward H Cho, Andy WC Pang, Mahendra Rao, Han Cao, Nicholas J Schork, Jeanne F Loring

Identificación de PubMed:

26892726

Subvenciones de financiación:

Centro TSRI para la investigación de hESC
Laboratorio colaborativo para la investigación de células madre embrionarias humanas en el Instituto de Investigación Médica Sanford-Burnham
La matriz de células madre: un mapa de las vías moleculares que definen las células pluripotentes
Garantizar la seguridad de la terapia celular: un proceso de control de calidad para la purificación y validación celular
Ensayos de diagnóstico molecular predictivos fáciles de usar para el control de calidad de derivados de células madre para trasplantes y descubrimiento de fármacos

Resumen público:

Utilizamos la secuenciación del genoma completo para preguntar si la reprogramación de células somáticas humanas introducía mutaciones que pudieran ser preocupantes para la seguridad de las células. Determinamos que tres métodos de reprogramación en los que los factores de Yamanaka fueron administrados por retrovirus, virus Sendai o ARNm no introdujeron mutaciones que hicieran que las células fueran inapropiadas para la terapia de trasplante celular. Nuestra conclusión es que la reprogramación es generalmente benigna.

Resumen científico:

Existe la preocupación de que las tensiones derivadas de la inducción de la pluripotencia puedan provocar mutaciones nocivas en el ADN en líneas de células madre pluripotentes inducidas (iPSC), lo que comprometería su uso para terapias celulares. Aquí presentamos un análisis genómico comparativo de nueve líneas iPSC isogénicas generadas utilizando tres métodos de reprogramación: integración de vectores retrovirales, virus Sendai no integrante y ARNm sintéticos. Utilizamos secuenciación del genoma completo y mapeo del genoma de novo para identificar variantes, inserciones y eliminaciones de un solo nucleótido, y variantes estructurales. Nuestros resultados muestran un número moderado de variantes en las iPSC que no eran evidentes en los fibroblastos parentales, lo que puede deberse a la reprogramación. Sólo hubo pequeñas diferencias en el número total y los tipos de variantes entre los diferentes métodos de reprogramación. Lo más importante es que un análisis genómico exhaustivo mostró que las variantes eran en general benignas. Concluimos que es poco probable que el proceso de reprogramación introduzca variantes que hagan que las células sean inapropiadas para la terapia.