Análisis Perturb-seq multiómico in vivo con captura mejorada de gRNA nuclear.
Año de publicación:
2026
Identificación de PubMed:
41889810
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
El cribado CRISPR in vivo con análisis transcriptómicos y de cromatina combinados se ha visto limitado por la recuperación ineficiente de los ARN guía (ARNg) de los núcleos celulares. En este trabajo, desarrollamos Perturb-seq multiómico in vivo, una plataforma eficaz que combina el anclaje de transcritos nucleares con la captura y amplificación específicas de ARNg para permitir la asignación de ARNg de alta fidelidad y alta recuperación, así como análisis multiómicos escalables de núcleo único con resolución de perturbaciones. La aplicación de esta plataforma para investigar genes de riesgo de trastornos del neurodesarrollo en la corteza en desarrollo revela fenotipos de perturbación transcriptómica y epigenómica específicos de cada tipo celular.
Resumen científico:
El cribado CRISPR in vivo con análisis transcriptómicos y de cromatina combinados se ha visto limitado por la recuperación ineficiente de los ARN guía (ARNg) de los núcleos celulares. En este trabajo, desarrollamos Perturb-seq multiómico in vivo, una plataforma eficaz que combina el anclaje de transcritos nucleares con la captura y amplificación específicas de ARNg para permitir la asignación de ARNg de alta fidelidad y alta recuperación, así como análisis multiómicos escalables de núcleo único con resolución de perturbaciones. La aplicación de esta plataforma para investigar genes de riesgo de trastornos del neurodesarrollo en la corteza en desarrollo revela fenotipos de perturbación transcriptómica y epigenómica específicos de cada tipo celular.