Las redes dependientes de TFAP2C y p63 reorganizan secuencialmente los paisajes de cromatina para impulsar el compromiso del linaje epidérmico humano.

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Año de publicación:
2019
Autores:
Lingjie Li, Yong Wang, Jessica L Torkelson, Gautam Shankar, Jillian M Pattison, Hanson H Zhen, Fengqin Fang, Zhana Duren, Jingxue Xin, Sadhana Gaddam, Sandra P Melo, Samantha N Piekos, Jiang Li, Eric J Liaw, Lang Chen , Rui Li, Marius Wernig, Wing H Wong, Howard Y Chang, Anthony E Oro
Identificación de PubMed:
30686763
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
El desarrollo del tejido es el resultado de factores de transcripción (TF) específicos del linaje que programan un paisaje dinámico de cromatina a través de transiciones progresivas del destino celular. Aquí, definimos el paisaje epigenómico durante la diferenciación epidérmica de células madre pluripotentes (PSC) humanas y creamos redes de inferencia que integran la expresión genética, la accesibilidad a la cromatina y la unión de TF para definir mecanismos reguladores durante la especificación de los queratinocitos. Encontramos dos redes de cromatina críticas durante el inicio del ectodermo de superficie y la maduración de los queratinocitos, que son impulsadas por TFAP2C y p63, respectivamente. Consistentemente, TFAP2C, pero no p63, es suficiente para iniciar la diferenciación del ectodermo de superficie, y las células progenitoras iniciadas por TFAP2C son capaces de madurar hasta convertirse en queratinocitos funcionales. Mecánicamente, TFAP2C prepara el paisaje de cromatina del ectodermo de superficie e induce la expresión de p63 y los sitios de unión, lo que permite que el factor de maduración p63 autorregula positivamente su propia expresión y cierre un subconjunto del programa de ectodermo de superficie iniciado por TFAP2C. Nuestro trabajo proporciona un marco general para inferir redes TF que controlan las transiciones de cromatina que facilitarán futuros avances en la medicina regenerativa.
Resumen científico:
El desarrollo del tejido es el resultado de factores de transcripción (TF) específicos del linaje que programan un paisaje dinámico de cromatina a través de transiciones progresivas del destino celular. Aquí, definimos el paisaje epigenómico durante la diferenciación epidérmica de células madre pluripotentes (PSC) humanas y creamos redes de inferencia que integran la expresión genética, la accesibilidad a la cromatina y la unión de TF para definir mecanismos reguladores durante la especificación de los queratinocitos. Encontramos dos redes de cromatina críticas durante el inicio del ectodermo de superficie y la maduración de los queratinocitos, que son impulsadas por TFAP2C y p63, respectivamente. Consistentemente, TFAP2C, pero no p63, es suficiente para iniciar la diferenciación del ectodermo de superficie, y las células progenitoras iniciadas por TFAP2C son capaces de madurar hasta convertirse en queratinocitos funcionales. Mecánicamente, TFAP2C prepara el paisaje de cromatina del ectodermo de superficie e induce la expresión de p63 y los sitios de unión, lo que permite que el factor de maduración p63 autorregula positivamente su propia expresión y cierre un subconjunto del programa de ectodermo de superficie iniciado por TFAP2C. Nuestro trabajo proporciona un marco general para inferir redes TF que controlan las transiciones de cromatina que facilitarán futuros avances en la medicina regenerativa.