Los cambios sutiles en la propensión al contacto de los bucles de cromatina están asociados con la regulación y expresión génica diferencial.

Si bien la variación genética en los bucles de cromatina es relevante para las enfermedades humanas, las relaciones entre la propensión al contacto (la probabilidad de que los loci en los bucles interactúen físicamente), la genética y la regulación génica no están claras. Analizamos cuantitativamente estas relaciones comparando datos de Hi-C y fenotipos moleculares entre diferentes tipos celulares y haplotipos. Aunque los bucles de cromatina se forman de manera consistente en distintos tipos celulares, presentan sutiles diferencias cuantitativas en la frecuencia de contacto que se asocian con cambios mayores en la expresión génica y la acetilación de H3K27. Para la gran mayoría de los loci con diferencias cuantitativas en la frecuencia de contacto entre haplotipos, los cambios en magnitud son menores que los observados entre tipos celulares; sin embargo, las relaciones proporcionales entre la propensión al contacto, la expresión génica y la acetilación de H3K27 son consistentes. Estos hallazgos sugieren que los cambios sutiles en la propensión al contacto desempeñan un papel biológicamente significativo en la regulación génica y podrían ser un mecanismo mediante el cual las variantes genéticas reguladoras en los anclajes de los bucles median los efectos sobre la expresión.