Edición simultánea en múltiples sitios de genomas individuales utilizando matrices de retrones.

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Año de publicación:
2023
Autores:
Identificación de PubMed:
37503029
Resumen público:
Nuestra comprensión de la genómica está limitada por la escala de nuestras tecnologías genómicas. Si bien las bibliotecas de manipulaciones genómicas basadas en ARNg CRISPR han sido transformadoras, estos enfoques existentes suelen multiplexarse ​​entre genomas. Sin embargo, gran parte de la complejidad de los genomas reales se codifica dentro de un genoma en diferentes sitios. Desafortunadamente, la creación de células con múltiples mutaciones precisas no adyacentes sigue siendo un ciclo laborioso de edición, aislamiento de una célula editada y nueva edición. Aquí, describimos una tecnología para modificar con precisión múltiples sitios en un solo genoma simultáneamente. Esta tecnología, denominada multitrón, se construye a partir de un retron altamente modificado, en el que se producen múltiples MSD codificantes de donantes a partir de una sola transcripción. La arquitectura del multitrón es compatible tanto con la recombinación en células procariotas como con la edición CRISPR en células eucariotas. Demostramos aplicaciones de este enfoque en el registro molecular, la minimización de elementos genéticos y la ingeniería metabólica.
Resumen científico:
Nuestra comprensión de la genómica está limitada por la escala de nuestras tecnologías genómicas. Si bien las bibliotecas de manipulaciones genómicas basadas en ARNg CRISPR han sido transformadoras, estos enfoques existentes suelen multiplexarse ​​entre genomas. Sin embargo, gran parte de la complejidad de los genomas reales se codifica dentro de un genoma en diferentes sitios. Desafortunadamente, la creación de células con múltiples mutaciones precisas no adyacentes sigue siendo un ciclo laborioso de edición, aislamiento de una célula editada y nueva edición. Aquí, describimos una tecnología para modificar con precisión múltiples sitios en un solo genoma simultáneamente. Esta tecnología, denominada multitrón, se construye a partir de un retron altamente modificado, en el que se producen múltiples MSD codificantes de donantes a partir de una sola transcripción. La arquitectura del multitrón es compatible tanto con la recombinación en células procariotas como con la edición CRISPR en células eucariotas. Demostramos aplicaciones de este enfoque en el registro molecular, la minimización de elementos genéticos y la ingeniería metabólica.