Las redes reguladoras definen clases fenotípicas de líneas de células madre humanas.

Las células madre se definen como poblaciones de células autorrenovables que pueden diferenciarse en múltiples tipos de células distintas. Sin embargo, cientos de líneas celulares humanas diferentes de origen embrionario, fetal y adulto han sido denominadas células madre, aunque van desde células pluripotentes, tipificadas por células madre embrionarias, que son capaces de una proliferación y diferenciación prácticamente ilimitadas, hasta líneas de células madre adultas. , que puede generar un repertorio mucho más limitado de tipos de células diferenciadas. El rápido aumento de informes sobre nuevas fuentes de células madre y su valor previsto para la medicina regenerativa ha puesto de relieve la necesidad de un método general y reproducible para la clasificación de estas células. Informamos aquí la creación y análisis de una base de datos de perfiles globales de expresión genética (que llamamos 'matriz de células madre') que permite la clasificación de células madre humanas cultivadas en el contexto de una amplia variedad de tipos de células pluripotentes, multipotentes y diferenciadas. . Utilizando un método de agrupamiento no supervisado para categorizar una colección de aproximadamente 150 muestras de células, descubrimos que las líneas de células madre pluripotentes se agrupan, mientras que otros tipos de células, incluidas las líneas de células madre neurales derivadas del cerebro, son muy diversas. Utilizando análisis bioinformáticos adicionales, descubrimos una red proteína-proteína (PluriNet) que comparten las células pluripotentes (células madre embrionarias, carcinomas embrionarios y células pluripotentes inducidas). El análisis de los datos publicados mostró que PluriNet parece ser una característica común de las células pluripotentes, incluidas las células madre embrionarias de ratón y las células pluripotentes inducidas y los ovocitos humanos. Nuestros resultados ofrecen una nueva estrategia para clasificar las células madre y respaldan la idea de que la pluripotencia y la autorrenovación están bajo estricto control por redes moleculares específicas.