Una línea de células madre pluripotentes inducidas por humanos de referencia para estudios colaborativos a gran escala.

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Año de publicación:
2022
Autores:
Caroline B Pantazis, Andrian Yang, Erika Lara, Justin A McDonough, Cornelis Blauwendraat, Lirong Peng, Hideyuki Oguro, Jitendra Kanaujiya, Jizhong Zou, David Sebesta, Gretchen Pratt, Erin Cross, Jeffrey Blockwick, Philip Buxton, Lauren Kinner-Bibeau, Constance Medura, Christopher Tompkins, Stephen Hughes, Marianita Santiana, Faraz Faghri, Mike A Nalls, Daniel Vitale, Shannon Ballard, Yue A Qi, Daniel M Ramos, Kailyn M Anderson, Julia Stadler, Priyanka Narayan, Jason Papademetriou, Luke Reilly, Matthew P Nelson, Sanya Aggarwal, Leah U Rosen, Peter Kirwan, Venkat Pisupati, Steven L Coon, Sonja W Scholz, Theresa Priebe, Miriam Ottl, Jian Dong, Marieke Meijer, Lara JM Janssen, Vanessa S Lourenco, Rik van der Kant, Dennis Crusius , Dominik Paquet, Ana-Caroline Raulin, Guojun Bu, Aaron Held, Brian J Wainger, Rebecca MC Gabriele, Jackie M Casey, Selina Wray, Dad Abu-Bonsrah, Clare L Parish, Melinda S Beccari, Don W Cleveland, Emmy Li, Indigo VL Rose, Martin Kampmann, Carles Calatayud Aristoy, Patrik Verstreken, Laurin Heinrich, Max Y Chen, Birgitt Schule, Dan Dou, Erika LF Holzbaur, Maria Clara Zanellati, Richa Basundra, Mohanish Deshmukh, Sarah Cohen, Richa Khanna, Malavika Raman, Zachary S Nevin, Madeline Matia, Jonas Van Lent, Vincent Timmerman, Bruce R Conklin, Katherine Johnson Chase, Ke Zhang, Salome Funes, Daryl A Bosco, Lena Erlebach, Marc Welzer, Deborah Kronenberg-Versteeg, Guochang Lyu, Ernest Arenas, Elena Coccia, Lily Sarrafha, Tim Ahfeldt, John C Marioni, William C Skarnes, Mark R Cookson, Michael E Ward, Florian T Merkle
Identificación de PubMed:
36459969
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
Las líneas de células madre pluripotentes inducidas por humanos (iPSC) son una herramienta poderosa para estudiar el desarrollo y la enfermedad, pero la considerable variación fenotípica entre líneas dificulta replicar hallazgos clave e integrar datos entre grupos de investigación. Para abordar este problema, subclonamos líneas iPSC humanas candidatas y caracterizamos en profundidad sus propiedades genéticas mediante la secuenciación del genoma completo, su estabilidad genómica mediante la edición de genes basada en CRISPR-Cas9 y sus propiedades fenotípicas, incluida la diferenciación en tipos de células de uso común. Estos estudios identificaron a KOLF2.1J como una línea iPSC de buen rendimiento en todos los aspectos. Luego compartimos KOLF2.1J con grupos de todo el mundo que probaron su rendimiento en comparaciones directas con sus propias líneas iPSC preferidas en una amplia gama de protocolos de diferenciación y ensayos funcionales. Sobre la base de estos hallazgos, hemos hecho que KOLF2.1J y sus clones derivados editados genéticamente sean fácilmente accesibles para promover la estandarización requerida para la ciencia colaborativa a gran escala en el campo de las células madre.
Resumen científico:
Las líneas de células madre pluripotentes inducidas por humanos (iPSC) son una herramienta poderosa para estudiar el desarrollo y la enfermedad, pero la considerable variación fenotípica entre líneas dificulta replicar hallazgos clave e integrar datos entre grupos de investigación. Para abordar este problema, subclonamos líneas iPSC humanas candidatas y caracterizamos en profundidad sus propiedades genéticas mediante la secuenciación del genoma completo, su estabilidad genómica mediante la edición de genes basada en CRISPR-Cas9 y sus propiedades fenotípicas, incluida la diferenciación en tipos de células de uso común. Estos estudios identificaron a KOLF2.1J como una línea iPSC de buen rendimiento en todos los aspectos. Luego compartimos KOLF2.1J con grupos de todo el mundo que probaron su rendimiento en comparaciones directas con sus propias líneas iPSC preferidas en una amplia gama de protocolos de diferenciación y ensayos funcionales. Sobre la base de estos hallazgos, hemos hecho que KOLF2.1J y sus clones derivados editados genéticamente sean fácilmente accesibles para promover la estandarización requerida para la ciencia colaborativa a gran escala en el campo de las células madre.