NDEx, el intercambio de datos en red.

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Año de publicación:
2015
Autores:
Identificación de PubMed:
26594663
Resumen público:
Las redes son una metodología poderosa y flexible para expresar conocimiento biológico para la computación y la comunicación. La información codificada en red puede incluir pantallas sistemáticas de interacciones moleculares, relaciones biológicas seleccionadas de la literatura y resultados de análisis de Big Data. NDEx, Network Data Exchange (www.ndexbio.org), es un bien común en línea donde los científicos pueden cargar, compartir y distribuir públicamente redes. Las redes en NDEx reciben ID de acceso únicas a nivel mundial y pueden almacenarse para uso privado, compartirse en colaboración previa a la publicación o publicarse para acceso público. Los formatos de datos estándar y novedosos se incluyen en un modelo de almacenamiento flexible. Las organizaciones pueden utilizar NDEx como canal de distribución para las redes que generan o seleccionan. Los desarrolladores de aplicaciones bioinformáticas pueden almacenar y consultar redes NDEx a través de una interfaz programática común. NDEx ayuda a ampliar el papel de las redes en el discurso científico y facilita la integración de redes como datos en publicaciones. Es un paso hacia un ecosistema en el que las redes que transportan datos, hipótesis y hallazgos fluyan fácilmente entre los científicos.
Resumen científico:
Las redes son una metodología poderosa y flexible para expresar conocimiento biológico para la computación y la comunicación. La información codificada en red puede incluir pantallas sistemáticas de interacciones moleculares, relaciones biológicas seleccionadas de la literatura y resultados de análisis de Big Data. NDEx, Network Data Exchange (www.ndexbio.org), es un bien común en línea donde los científicos pueden cargar, compartir y distribuir públicamente redes. Las redes en NDEx reciben ID de acceso únicas a nivel mundial y pueden almacenarse para uso privado, compartirse en colaboración previa a la publicación o publicarse para acceso público. Los formatos de datos estándar y novedosos se incluyen en un modelo de almacenamiento flexible. Las organizaciones pueden utilizar NDEx como canal de distribución para las redes que generan o seleccionan. Los desarrolladores de aplicaciones bioinformáticas pueden almacenar y consultar redes NDEx a través de una interfaz programática común. NDEx ayuda a ampliar el papel de las redes en el discurso científico y facilita la integración de redes como datos en publicaciones. Es un paso hacia un ecosistema en el que las redes que transportan datos, hipótesis y hallazgos fluyan fácilmente entre los científicos.