Un ARN largo no codificante mantiene la cromatina activa para coordinar la expresión de genes homeóticos.
Año de publicación:
2011
Identificación de PubMed:
21423168
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
El genoma se transcribe ampliamente en ARN no codificantes intergénicos largos (lincRNA), muchos de los cuales están implicados en el silenciamiento de genes. Se conocen mucho menos las posibles funciones de los lincRNA en la activación de genes. El desarrollo y la homeostasis requieren una regulación coordinada de los genes vecinos mediante un proceso denominado control del locus. Algunos elementos de control de locus y potenciadores transcriben lincRNA, lo que sugiere posibles funciones en el control a largo plazo. En los vertebrados, 39 genes Hox, que codifican factores de transcripción del homeodominio críticos para la identidad posicional, están agrupados en cuatro loci cromosómicos; Los genes Hox se expresan en patrones anteroposteriores y proximal-distales anidados colineales con su posición genómica de 3' a 5' del grupo. Aquí identificamos HOTTIP, un lincRNA transcrito desde la punta 5' del locus HOXA que coordina la activación de varios genes 5' HOXA in vivo. El bucle cromosómico acerca a HOTTIP a sus genes diana. HOTTIP RNA se une directamente a la proteína adaptadora WDR5 y se dirige a los complejos WDR5/MLL a través de HOXA, impulsando la trimetilación de la histona H3 lisina 4 y la transcripción genética. La proximidad inducida es necesaria y suficiente para que HOTTIP RNA active sus genes diana. Por lo tanto, al servir como intermediarios clave que transmiten información desde bucles cromosómicos de orden superior hacia modificaciones de la cromatina, los lincRNA pueden organizar dominios de cromatina para coordinar la activación genética de largo alcance.
Resumen científico:
El genoma se transcribe ampliamente en ARN no codificantes intergénicos largos (lincRNA), muchos de los cuales están implicados en el silenciamiento de genes. Se conocen mucho menos las posibles funciones de los lincRNA en la activación de genes. El desarrollo y la homeostasis requieren una regulación coordinada de los genes vecinos mediante un proceso denominado control del locus. Algunos elementos de control de locus y potenciadores transcriben lincRNA, lo que sugiere posibles funciones en el control a largo plazo. En los vertebrados, 39 genes Hox, que codifican factores de transcripción del homeodominio críticos para la identidad posicional, están agrupados en cuatro loci cromosómicos; Los genes Hox se expresan en patrones anteroposteriores y proximal-distales anidados colineales con su posición genómica de 3' a 5' del grupo. Aquí identificamos HOTTIP, un lincRNA transcrito desde la punta 5' del locus HOXA que coordina la activación de varios genes 5' HOXA in vivo. El bucle cromosómico acerca a HOTTIP a sus genes diana. HOTTIP RNA se une directamente a la proteína adaptadora WDR5 y se dirige a los complejos WDR5/MLL a través de HOXA, impulsando la trimetilación de la histona H3 lisina 4 y la transcripción genética. La proximidad inducida es necesaria y suficiente para que HOTTIP RNA active sus genes diana. Por lo tanto, al servir como intermediarios clave que transmiten información desde bucles cromosómicos de orden superior hacia modificaciones de la cromatina, los lincRNA pueden organizar dominios de cromatina para coordinar la activación genética de largo alcance.