LIN28 se une a los ARN mensajeros en motivos GGAGA y regula la abundancia del factor de empalme.

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Año de publicación:
2012
Autores:
Melissa L Wilbert, Stephanie C Huelga, Katannya Kapeli, Thomas J Stark, Tiffany Y Liang, Stella X Chen, Bernice Y Yan, Jason L Nathanson, Kasey R Hutt, Michael T Lovci, Hilal Kazan, Anthony Q Vu, Katlin B Massirer, Quaid Morris, Shawn Hoon, Gene W Yeo
Identificación de PubMed:
22959275
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
Uno de los genes clave importantes en la autorrenovación y la pluripotencia de las células madre, y que también se utiliza para reprogramar células somáticas en células madre pluripotentes inducidas, es la proteína de unión a ARN LIN28. Para comprender las funciones de LIN28 en la regulación de los genes que son importantes en este proceso, hemos realizado experimentos bioquímicos seguidos de secuenciación para identificar los objetivos de ARN de LIN28. Descubrimos que LIN28 regula otras proteínas de unión a ARN que regulan los patrones de empalme de genes expresados ​​en la célula, lo que representa un nuevo modo de regulación por parte de esta proteína de unión a ARN, que se cree que solo actúa a través de microARN.
Resumen científico:
LIN28 es una proteína de unión a ARN conservada implicada en la pluripotencia, la reprogramación y la oncogénesis. Anteriormente se demostró que actúa principalmente bloqueando la biogénesis del microARN (miARN) let-7, pero aquí dilucidamos distintas funciones de la regulación de LIN28 a través de sus objetivos de ARN mensajero directo (ARNm). Mediante entrecruzamiento e inmunoprecipitación junto con secuenciación de alto rendimiento CLIP-seq en células madre embrionarias humanas y células somáticas que expresan LIN28 exógeno, hemos definido sitios de unión de LIN28 discretos en una cuarta parte de las transcripciones humanas. Estos sitios revelaron que LIN28 se une a secuencias GGAGA enriquecidas dentro de estructuras de bucle en ARNm, que recuerdan su interacción con los precursores de miARN let-7. Entre los objetivos de ARNm de LIN28, encontramos evidencia de la autorregulación de LIN28 y también efectos directos pero diferentes sobre la abundancia de proteínas de los reguladores de empalme en células madre somáticas y pluripotentes. Los microarrays sensibles al empalme demostraron que la expresión exógena de LIN28 provoca cambios generalizados en el empalme alternativo posterior. Estos hallazgos identifican importantes funciones reguladoras de LIN28 a través de interacciones directas de ARNm.