Los interactomas de los potenciadores POU5F1 y SOX2 en células madre embrionarias humanas.
Año de publicación:
2013
Identificación de PubMed:
23549118
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
Este artículo describe la estructura nuclear tridimensional de células madre pluripotentes humanas. Revela las características de la interacción cromosómica y cómo puede regular la expresión genética en células madre pluripotentes y su reprogramación.
Resumen científico:
Los genes POU5F1 y SOX2 son fundamentales para la pluripotencia y la reprogramación, pero la organización cromosómica en torno a estos genes sigue siendo poco conocida. Ensayamos interacciones cromosómicas de largo alcance en supuestos potenciadores de los genes POU5F1 y SOX2 en células madre embrionarias humanas (hESC) utilizando la técnica 4C-Seq. Descubrimos que sus frecuentes regiones de interacción se superponen principalmente con los primeros dominios de replicación del ADN. Los interactomas están asociados con marcas de histonas activas y enriquecidos con sitios de 5-hidroximetilcitosina. En las hESC, los genes dentro de los interactomas tienen una expresión elevada. Además, algunos genes asociados con el potenciador POU5F1 contribuyen a la pluripotencia. Los sitios de unión para múltiples proteínas de unión al ADN, incluidas ATF3, CTCF, GABPA, JUND, NANOG, RAD21 y YY1, están enriquecidos en ambos interactomas. El locus RARG, que interactúa frecuentemente con el locus POU5F1, tiene abundantes sitios de unión a RAD21 co-localizados con otros sitios de unión a proteínas. Por tanto, los interactomas de estos dos genes de pluripotencia podrían ser una parte importante de la red reguladora de las hESC.