Identificación de nuevos ARN largos no codificantes que subyacen al desarrollo cardiovascular de los vertebrados.
Año de publicación:
2015
Identificación de PubMed:
25739401
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
ANTECEDENTES: Los ARN largos no codificantes (lncRNA) se han convertido en reguladores epigenéticos críticos con funciones importantes en el desarrollo y la enfermedad. Aquí, buscamos identificar y caracterizar funcionalmente nuevos lncRNA críticos para el desarrollo de vertebrados. MÉTODOS Y RESULTADOS: Basándonos en modelos de diferenciación de células madre pluripotentes humanas, investigamos los lncRNA regulados diferencialmente en pasos clave durante el desarrollo cardiovascular humano con un enfoque especial en las células endoteliales vasculares. La secuenciación de ARN condujo a la generación de grandes conjuntos de datos que sirven como hoja de ruta de expresión genética que destaca los cambios en la expresión genética durante la diferenciación de células pluripotentes humanas. Los análisis de etapas específicas llevaron a la identificación de tres lncRNA no caracterizados previamente, TERMINATOR, ALIEN y PUNISHER, expresados específicamente en células madre pluripotentes indiferenciadas, progenitores cardiovasculares y células endoteliales diferenciadas, respectivamente. La caracterización funcional, incluidos estudios de localización, análisis de expresión dinámica, monitoreo de modificaciones epigenéticas y experimentos de eliminación en vertebrados inferiores, así como en embriones murinos y células humanas, confirmaron un papel crítico para cada lncRNA específico para cada etapa de desarrollo analizada. CONCLUSIONES: Hemos identificado y caracterizado funcionalmente 3 nuevos lncRNA involucrados en el desarrollo cardiovascular humano y de vertebrados, y proporcionamos una hoja de ruta transcriptómica integral que arroja nueva luz sobre los mecanismos moleculares subyacentes al desarrollo embrionario humano, el compromiso mesodérmico y la especificación cardiovascular.
Resumen científico:
ANTECEDENTES: Los ARN largos no codificantes (lncRNA) se han convertido en reguladores epigenéticos críticos con funciones importantes en el desarrollo y la enfermedad. Aquí, buscamos identificar y caracterizar funcionalmente nuevos lncRNA críticos para el desarrollo de vertebrados. MÉTODOS Y RESULTADOS: Basándonos en modelos de diferenciación de células madre pluripotentes humanas, investigamos los lncRNA regulados diferencialmente en pasos clave durante el desarrollo cardiovascular humano con un enfoque especial en las células endoteliales vasculares. La secuenciación de ARN condujo a la generación de grandes conjuntos de datos que sirven como hoja de ruta de expresión genética que destaca los cambios en la expresión genética durante la diferenciación de células pluripotentes humanas. Los análisis de etapas específicas llevaron a la identificación de tres lncRNA no caracterizados previamente, TERMINATOR, ALIEN y PUNISHER, expresados específicamente en células madre pluripotentes indiferenciadas, progenitores cardiovasculares y células endoteliales diferenciadas, respectivamente. La caracterización funcional, incluidos estudios de localización, análisis de expresión dinámica, monitoreo de modificaciones epigenéticas y experimentos de eliminación en vertebrados inferiores, así como en embriones murinos y células humanas, confirmaron un papel crítico para cada lncRNA específico para cada etapa de desarrollo analizada. CONCLUSIONES: Hemos identificado y caracterizado funcionalmente 3 nuevos lncRNA involucrados en el desarrollo cardiovascular humano y de vertebrados, y proporcionamos una hoja de ruta transcriptómica integral que arroja nueva luz sobre los mecanismos moleculares subyacentes al desarrollo embrionario humano, el compromiso mesodérmico y la especificación cardiovascular.