Caracterización funcional y molecular del papel de CTCF en la biología de células madre embrionarias humanas.
Año de publicación:
2012
Identificación de PubMed:
22879976
Subvenciones de financiación:
Resumen público:
El factor de unión a CCCTC CTCF es la única proteína aislante de vertebrados conocida y se ha demostrado que regula importantes procesos de desarrollo como la impronta, la inactivación del cromosoma X y la arquitectura genómica. En este estudio, examinamos el papel de CTCF en la biología de células madre embrionarias humanas (hESC). Demostramos que CTCF se asocia con varios genes de pluripotencia importantes, incluidos NANOG, SOX2, cMYC y LIN28, y es fundamental para la proliferación de hESC. El agotamiento de CTCF afecta la expresión de genes de pluripotencia y acelera la pérdida de pluripotencia tras la diferenciación inducida por BMP4, pero no da como resultado una diferenciación espontánea. Encontramos que CTCF se asocia con los extremos distales y los sitios internos del locus NANOG-DPPA160-GDF3 de 3 kb corregulado. Cada uno de estos sitios puede funcionar como un aislante de bloqueo del potenciador dependiente de CTCF en ensayos heterólogos. En las hESC, el CTCF existe en complejos proteicos de múltiples subunidades y puede estar poli(ADP)ribosilado. Los cofactores CTCF conocidos, como Cohesin, se localizan diferencialmente en las proximidades de sitios de unión de CTCF específicos dentro del locus NANOG. Es importante destacar que la asociación de algunos cofactores y la proteína PARlation cambia selectivamente tras la diferenciación, aunque la unión de CTCF permanece constante. Comprender cómo los cofactores únicos pueden impartir funciones especializadas al CTCF en ubicaciones genómicas específicas iluminará aún más su papel en la biología de las células madre.
Resumen científico:
El factor de unión a CCCTC CTCF es la única proteína aislante de vertebrados conocida y se ha demostrado que regula importantes procesos de desarrollo como la impronta, la inactivación del cromosoma X y la arquitectura genómica. En este estudio, examinamos el papel de CTCF en la biología de células madre embrionarias humanas (hESC). Demostramos que CTCF se asocia con varios genes de pluripotencia importantes, incluidos NANOG, SOX2, cMYC y LIN28, y es fundamental para la proliferación de hESC. El agotamiento de CTCF afecta la expresión de genes de pluripotencia y acelera la pérdida de pluripotencia tras la diferenciación inducida por BMP4, pero no da como resultado una diferenciación espontánea. Encontramos que CTCF se asocia con los extremos distales y los sitios internos del locus NANOG-DPPA160-GDF3 de 3 kb corregulado. Cada uno de estos sitios puede funcionar como un aislante de bloqueo del potenciador dependiente de CTCF en ensayos heterólogos. En las hESC, el CTCF existe en complejos proteicos de múltiples subunidades y puede estar poli(ADP)ribosilado. Los cofactores CTCF conocidos, como Cohesin, se localizan diferencialmente en las proximidades de sitios de unión de CTCF específicos dentro del locus NANOG. Es importante destacar que la asociación de algunos cofactores y la proteína PARlation cambia selectivamente tras la diferenciación, aunque la unión de CTCF permanece constante. Comprender cómo los cofactores únicos pueden impartir funciones especializadas al CTCF en ubicaciones genómicas específicas iluminará aún más su papel en la biología de las células madre.