Un censo experimental de retrones para la producción de ADN y la edición del genoma.

Los retrones son sistemas inmunitarios bacterianos que utilizan ADN de transcripción inversa como detector de infecciones por fagos. Su uso también es cada vez mayor en biotecnología. Por ejemplo, para la edición genómica, los retrones se modifican para que el ADN de transcripción inversa (RT-ADN) codifique un donante de edición. Los retrones se encuentran comúnmente en genomas bacterianos; miles de retrones únicos se han predicho bioinformáticamente. Sin embargo, solo un pequeño número se ha caracterizado experimentalmente. En este trabajo, ampliamos sustancialmente el corpus de retrones estudiados experimentalmente. Sintetizamos más de 100 retrones no probados previamente para identificar la secuencia natural de RT-ADN que producen, cuantificar su producción y evaluar la eficacia relativa de la edición utilizando donantes derivados de retrones para editar genomas bacterianos, fagos y humanos. Añadimos 62 nuevos RT-ADN naturales, determinados empíricamente, que no son predecibles únicamente a partir de la secuencia del retron. Informamos una gran diversidad en las tasas de producción y edición de RT-ADN entre retrones, y encontramos que los editores de mayor rendimiento superan a los utilizados en estudios anteriores y provienen de un subconjunto de la filogenia de los retrones.