Un atlas de cambios transcripcionales, de accesibilidad a la cromatina y de marcadores de superficie en el desarrollo del mesodermo humano.
Año de publicación:
2016
Identificación de PubMed:
27996962
Subvenciones de financiación:
- Herramientas de anticuerpos para agotar o aislar células madre teratogénicas, cardíacas y sanguíneas de hESC
- Centro de excelencia para la genómica de células madre - Stanford
- Identificación y aislamiento de células madre hematopoyéticas humanas trasplantables a partir de líneas celulares pluripotentes; dos pasos desde la hematopoyesis primitiva hasta las células definitivas trasplantables y el acondicionamiento no tóxico de huéspedes para el transporte de células madre hematopoyéticas...
Resumen público:
El mesodermo es el precursor del desarrollo de innumerables tejidos humanos, incluidos los huesos, el corazón y el músculo esquelético. Desentrañar los eventos moleculares a través de los cuales estos linajes se diversifican entre sí es parte integral de la biología del desarrollo y la comprensión de los cambios en el destino celular. Con este fin, desarrollamos un sistema in vitro para diferenciar células madre pluripotentes humanas a través de intermediarios de la raya primitiva en mesodermo paraxial y sus derivados (somitas, esclerotoma, dermomiotoma) y, por separado, en mesodermo lateral y sus derivados (mesodermo cardíaco). Los análisis de poblaciones enteras y unicelulares de estas poblaciones purificadas de linajes de mesodermo humano a través de RNA-seq, ATAC-seq y pantallas de marcadores de superficie de alto rendimiento ilustraron cómo los cambios transcripcionales coexisten con los cambios en la cromatina abierta y los paisajes de marcadores de superficie en todo el ser humano. desarrollo del mesodermo. Este atlas molecular facilitará el estudio del desarrollo del mesodermo humano (que no puede examinarse in vivo debido a restricciones en los estudios de embriones humanos) y proporciona un amplio recurso para el estudio de la regulación genética en el desarrollo a nivel unicelular, conocimiento que algún día podría ser explotado para la medicina regenerativa.
Resumen científico:
El mesodermo es el precursor del desarrollo de innumerables tejidos humanos, incluidos los huesos, el corazón y el músculo esquelético. Desentrañar los eventos moleculares a través de los cuales estos linajes se diversifican entre sí es parte integral de la biología del desarrollo y la comprensión de los cambios en el destino celular. Con este fin, desarrollamos un sistema in vitro para diferenciar células madre pluripotentes humanas a través de intermediarios de la raya primitiva en mesodermo paraxial y sus derivados (somitas, esclerotoma, dermomiotoma) y, por separado, en mesodermo lateral y sus derivados (mesodermo cardíaco). Los análisis de poblaciones enteras y unicelulares de estas poblaciones purificadas de linajes de mesodermo humano a través de RNA-seq, ATAC-seq y pantallas de marcadores de superficie de alto rendimiento ilustraron cómo los cambios transcripcionales coexisten con los cambios en la cromatina abierta y los paisajes de marcadores de superficie en todo el ser humano. desarrollo del mesodermo. Este atlas molecular facilitará el estudio del desarrollo del mesodermo humano (que no puede examinarse in vivo debido a restricciones en los estudios de embriones humanos) y proporciona un amplio recurso para el estudio de la regulación genética en el desarrollo a nivel unicelular, conocimiento que algún día podría ser explotado para la medicina regenerativa.