Aplicación de una técnica basada en matrices de bajo coste (TAB-Array) para cuantificar y mapear 5 mC y 5 hmC con una resolución de base única en células madre pluripotentes humanas.

La 5-hidroximetilcitosina (5hmC), un derivado oxidado de la 5-metilcitosina (5mC), ha sido implicada como un importante regulador epigenético del desarrollo de los mamíferos. Los procedimientos actuales utilizan métodos de secuenciación de ADN para discriminar 5 hmC de 5 mC, lo que limita su accesibilidad para la comunidad científica. Aquí presentamos un método que combina la conversión de bisulfito asistida por TET con matrices de metilación de ADN Illumina 450K para un enfoque de bajo costo y alto rendimiento que distingue señales de 5 hmC y 5 mC con resolución base. Al implementar este enfoque, denominado "matriz TAB", evaluamos la dinámica de metilación del ADN en la diferenciación de células madre pluripotentes humanas en progenitores cardiovasculares y células precursoras neurales. Con la capacidad de discriminar 5mC y 5hmC, identificamos una gran cantidad de nuevas regiones genómicas metiladas dinámicamente que están implicadas en el desarrollo de estos linajes. La mayor resolución y precisión que ofrece este enfoque proporciona un medio poderoso para investigar las distintas contribuciones de 5mC y 5hmC en el desarrollo humano y las enfermedades.